火山活動（ホットスポットの活動）で出来た島で、各大陸とは隔絶された独自の進化を遂げた固有種が多く存在する。天敵になるような大型の陸棲哺乳類が存在しない。
ガラパゴスゾウガメ - 大型のリクガメ。甲羅がドーム型のものと鞍型のものに分けられる。
ガラパゴスペンギン -
世界で2番目に小さく、唯一の熱帯性ペンギン。フンボルト海流から流れる魚類を餌にしているが、近年のエルニーニョ現象により餌が減り、個体数も減少した。
ガラパゴスリクイグアナ - サンタフェ島にはConolophus
pallidusが、その他の島にはConolophus
subcristatusが生息していたが、既に絶滅した島もある。主にウチワサボテンを食べるが、移入されたヤギによって食料が奪われ、存続が危ぶまれている。
ウミイグアナ - 海岸に生息し、海草などを食べる。海棲のイグアナである点で異端。
ヨウガントカゲ - 各島に1種、全部で7種が生息する。
ガラパゴスアシカ
ガラパゴスオットセイ
